Жеребьевку квалификации вместе с заместителем генерального секретаря УЕФА Джорджио Маркетти провел капитан хозяев финальной стадии прошлого розыгрыша Михаэль Краус, который получил от имени «Баварии» награду «фэйр-плей» Respect.

По итогам жеребьевки «Спарта» попала в группу «В» к командам из Казахстана, Северной Македонии и Мальты. Страной хозяйкой этого этапа, который пройдет с 24 по 30 мая, станет Мальта. В промежуточный раунд из группы выйдут победитель и команда, занявшая второе место. Там возможными соперниками «Спарты» в зависимости от занятого места будут команды из Хорватии, Литвы, Италии либо Испании, Северной Ирландии, Сербии. Восемь победителей промежуточного раунда выйдут в финальную стадию. Матчи решающей части планируется провести в две последние недели июня 2021 года.